Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms