Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim6Q8BGE7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms