Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms