Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms