Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q80Y73 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q80Y73 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms