Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms