Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms