Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms