Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Lamp3Q7TST5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lamp3Q7TST5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Lamp3Q7TST5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lamp3Q7TST5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lamp3Q7TST5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms