Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms