Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Dsg1bQ7TSF1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Dsg1bQ7TSF1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms