Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LnpkQ7TQ95 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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