Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms