Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms