Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim12Q78RX3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms