Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rph3alQ768S4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rph3alQ768S4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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