Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms