Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms