Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms