Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms