Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms