Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms