Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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