Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tpm4Q6IRU2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tpm4Q6IRU2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tpm4Q6IRU2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tpm4Q6IRU2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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