Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms