Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms