Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc2Q69ZB8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms