Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrcc1Q69ZB0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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