Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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