Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Irf4Q64287 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf4Q64287 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf4Q64287 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf4Q64287 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf4Q64287 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf4Q64287 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf4Q64287 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms