Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifit1Q64282 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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