Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Polr2kQ63871 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms