Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Taf6Q62311 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms