Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rbm38Q62176 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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