Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms