Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms