Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tfap2bQ61313 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tfap2bQ61313 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tfap2bQ61313 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tfap2bQ61313 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tfap2bQ61313 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tfap2bQ61313 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tfap2bQ61313 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tfap2bQ61313 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tfap2bQ61313 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms