Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igbp1Q61249 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igbp1Q61249 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms