Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms