Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms