Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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