Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3aQ60520 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms