Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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