Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynrgQ5SV85 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms