Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sun3Q5SS91 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sun3Q5SS91 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms