Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms