Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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