Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trappc1Q5NCF2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Trappc1Q5NCF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Trappc1Q5NCF2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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