Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Syne3Q4FZC9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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