Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1nQ497L1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms